Poco se sabe de sus inicios artísticos. La primera mención de él es de 1739, cuando su ópera "Lucio Papirio dittatore" se representó en Graz, Austria, por la compañía de ópera itinerante italiana de Pietro Mingotti. El 21 de noviembre de 1745 fue nombrado Kapellmeister auxiliar de la corte de Bonn del Arzobispo Clemens August de Colonia. Retuvo este puesto hasta 1752, y luego, probablemente trabajando con la compañía de ópera itinerante de Locatelli, fue a Praga, donde comenzó a colaborar con Christian Willibald Gluck y G. M. Rutini. Zoppis compuso su primera ópera de Praga, "Il Vologeso", que se representó en 1753. Un año más tarde, en 1754, introdujo otra ópera -"Siroe, re di Persia". La música fue escrita sobre el libreto de Pietro Metastasio.

Zoppis dejó Praga, junto con Locatelli y se trasladó en 1757 a San Petersburgo, donde produjo su ópera "Didone abbandonata" en 1758 y "La Galatea" dos años después. Fue nombrado director de orquesta asistente de la ópera italiana bajo Raupach, y fue promovido posteriormente a director titular.

Se piensa que asumió la dirección del coro de la capilla imperial después que Galuppi dejara Rusia en 1768. En 1781 Zoppis dejó San Petersburgo y probablemente volvió a Italia. Entre sus otras obras hay un oratorio sobre la obra "Isacco", de Pietro Metastasio, un "Te Deum" en Re Mayor, cantatas y arias.